Krónikus infekció

A gyors evolúciós változás alternatív inkubátora a krónikus fertőzésben szenvedő alany. Itt a vírus hetekig, hónapokig sokszorozódhat, melynek során különböző mutációk alakulhatnak ki. 

A krónikus infekció lehetőség a vírus számára, hogy macska-egér játékot játsszon az immunrendszerrel. Egy esetismertetés (2020)

Egy esetismertetés (2020): https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33176080/

Egy 45 éves immunkompromittált betegben perzisztáló fertőzés alakult ki, melynek közel öt hónapja alatt a SARS-CoV-2 törzseken közel egy tucat aminosavváltozás volt detektálható a spike proteinben. Mivel a receptorkötő domain könnyű célpont az antitestek számára, komoly szelekciós nyomás alatt állhat egy krónikus fertőzés során. Ugyanakkor az omikronban található mutációk száma vélhetően túl sok, hogy egy emberben alakult volna ki. Ráadásul az omikronban található mutációk erősítik egymás (a vírus számára) kedvező hatásait.

Például az N501Y és a Q498R együttesen a vírus ACE2 kötődési képességét 20-szorosára növeli.

Forrás: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.23.473975v1